第一段中國之旅

1641年，卜彌格說服了耶穌會會長 Mutio Vitelleschi讓他得以啟程前往亞洲執行任務。他獲得了波蘭的耶穌會省長、同時也是耶穌會克拉科夫學院校長 Marcin Hincza 的支持。11月27日，卜彌格得到了耶穌會的批準。

1643年3月30日，卜彌格在教宗烏爾班八世的加持之下，於里斯本和其他十名神職人員一起乘船前往澳門。他們途經非洲的東西海岸，並在葡萄牙殖民地的莫三比克港口渡過了冬天。在那裡他參加了狩獵河馬的活動，他形容此為"海馬"。他在一篇名為"Cafraria"的文章中描述了他的狩獵經歷以及對原住民的風俗等的描寫。隨後他也將此篇文章寄給了他的波蘭朋友牧師Cislak。

在春天，他們通過馬爾地夫航行到了印度，最終停在果阿港口，果阿是印度中西部的一個城市，被稱為東方羅馬，自1510年起一直由葡萄牙人所掌握。

於1644年底，他終於抵達澳門，然後被派往聖保羅學院講學和學習漢語。

1647年1月，卜彌格來到了海南島的丁縣，他在那裡開始了對當地動植物的研究和中醫實踐。他也開始著手製作中國地圖集"Magni Cathay"，並將他收集的脈搏診斷的經驗與未來的收集資料匯集成" Clavis Medica ad Chinarum Doctrinam de Pulsibus"和 "Flora Sinensis"兩本鉅作。

同年11月，海南島被滿清佔領之後，卜彌格與其他會士不得不撤離海南，他們乘上小船，於12月來到了位於越南北部的東京（法語稱為Tonkin）。

1648年，卜彌格仍舊為東京的特派團服務。同年他也前往了長安（現陜西西安），並製作了有名的西安府石的複製品，該石又稱作大秦景教碑，描述了 中國最早的基督徒景教（Nestorian）人於唐代的故事。（該石碑目前藏於西安碑林博物館）

在當時，明朝的大部份疆域都已被清軍奪走，卜彌格從長安返回Tonkin的路途中也見證到了節節敗退的明軍，而作為明朝代表的耶穌會士為了避開滿清的侵略者，不得不選擇一條穿越四川和雲南的路線回到東京（即Tonkin）。

1649年底，卜彌格從東京返回澳門進行佈道，中國地區的副會長 Alvar de Semedo神父(1585-1658)將他調派至廣東省肇慶市侍奉南明的最後一位皇帝永曆帝。他將在那裡協助另一個耶穌會士Andreas Koffler神父(1603-1651)，在這段期間他成功地將皇帝的家族如皇后、太后、太子以及皇帝本身皈依天主教，並以基督教的名字君士坦丁為其命名。